学院一贯重视学科建设，提出“把学科建设与科学研究、队伍建设、设施建设、人才培养、社会服务有机结合起来，整合学科资源，优化学科结构，凝炼学科方向，汇聚学科队伍，搭建学科平台，夯实学科基础，增强学科实力，提高学科水平，促进多学科协调发展。”的基本方针。近五年，这一方针得到落实，学院的学科建设取得了骄人的成绩。

2011年，学院抓住国家学科调整的重要机遇，申报并获批了生态学一级学科硕士授权点，使学院的一级学科硕士授权点增加到2个。2012年，在“植物学”省级重点学科的基础上，整合生物学其它二级学科资源，申报并获批了“生物学”省特色重点学科，2015年，又以学院为主，联合相关研究单位，申报并获批了“生态学”省特色重点学科。目前，学院拥有“生物学”和“生态学”两个一级学科硕士授权点，两个一级学科也都获得贵州省特色重点学科。学科布局得到进一步优化，学科整体实力得到进一步提升。